Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph14Q9D3W1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rsph14Q9D3W1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms