Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V8

Fam227a, Family with sequence similarity 227, member A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227aQ9D3V8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227aQ9D3V8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam227aQ9D3V8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms