Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed11Q9D2R4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms