Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930583I09RikQ9D2E3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930583I09RikQ9D2E3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930583I09RikQ9D2E3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms