Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snapc3Q9D2C9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snapc3Q9D2C9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms