Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q4

Dpm3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpm3Q9D1Q4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpm3Q9D1Q4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dpm3Q9D1Q4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms