Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MrnipQ9D1F5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms