Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cysrt1Q9D1E4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms