Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Susd3Q9D176 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Susd3Q9D176 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms