Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Hddc3Q9D114 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Hddc3Q9D114 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Hddc3Q9D114 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Hddc3Q9D114 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Hddc3Q9D114 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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Hddc3Q9D114 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Hddc3Q9D114 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Hddc3Q9D114 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Hddc3Q9D114 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Hddc3Q9D114 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Hddc3Q9D114 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hddc3Q9D114 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Hddc3Q9D114 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hddc3Q9D114 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Hddc3Q9D114 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hddc3Q9D114 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hddc3Q9D114 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hddc3Q9D114 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hddc3Q9D114 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Hddc3Q9D114 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hddc3Q9D114 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hddc3Q9D114 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Hddc3Q9D114 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Hddc3Q9D114 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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