Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E1

Hnrnpm, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpmQ9D0E1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HnrnpmQ9D0E1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HnrnpmQ9D0E1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
HnrnpmQ9D0E1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HnrnpmQ9D0E1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms