Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem39aQ9CYC3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem39aQ9CYC3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms