Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis12Q9CY25 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis12Q9CY25 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms