Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RpainQ9CWY9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RpainQ9CWY9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms