Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6kQ9CWP4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly6kQ9CWP4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms