Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atxn3Q9CVD2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atxn3Q9CVD2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atxn3Q9CVD2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms