Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Sycp2Q9CUU3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.7
Sycp2Q9CUU3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Sycp2Q9CUU3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Sycp2Q9CUU3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms