Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sppl3Q9CUS9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sppl3Q9CUS9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms