Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4930535I16RikQ9CUI2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms