Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snw1Q9CSN1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snw1Q9CSN1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms