Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd1Q9CRY7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd1Q9CRY7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd1Q9CRY7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd1Q9CRY7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd1Q9CRY7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Gdpd1Q9CRY7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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Gdpd1Q9CRY7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gdpd1Q9CRY7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd1Q9CRY7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms