Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pop4Q9CR08 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pop4Q9CR08 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms