Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psmd9Q9CR00 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmd9Q9CR00 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms