Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr3kQ9CQZ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr3kQ9CQZ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms