Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ykt6Q9CQW1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ykt6Q9CQW1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms