Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rer1Q9CQU3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rer1Q9CQU3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms