Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndufb9Q9CQJ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.8 ms