Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms