Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab5aQ9CQD1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms