Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NepnQ9CQ76 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NepnQ9CQ76 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms