Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl49Q9CQ40 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl49Q9CQ40 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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