Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc198Q9CPZ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc198Q9CPZ1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms