Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntnap2Q9CPW0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntnap2Q9CPW0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms