Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ska1Q9CPV1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ska1Q9CPV1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska1Q9CPV1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms