Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim26Q99PN3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim26Q99PN3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim26Q99PN3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim26Q99PN3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms