Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2a1Q99PM3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf2a1Q99PM3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms