Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930550L24RikQ99PA7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930550L24RikQ99PA7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930550L24RikQ99PA7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms