Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtn4Q99P72 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtn4Q99P72 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtn4Q99P72 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtn4Q99P72 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtn4Q99P72 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtn4Q99P72 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtn4Q99P72 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtn4Q99P72 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtn4Q99P72 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rtn4Q99P72 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms