Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdac9Q99N13 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac9Q99N13 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms