Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tdrd1Q99MV1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms