Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrrtQ99MR6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrrtQ99MR6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrrtQ99MR6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.1 ms