Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PccbQ99MN9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PccbQ99MN9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms