Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tm2d1Q99MB3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms