Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdpd3Q99LY2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gdpd3Q99LY2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms