Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp1b1Q99LU0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp1b1Q99LU0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms