Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rcbtb2Q99LJ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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