Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clp1Q99LI9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clp1Q99LI9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms