Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Usp16Q99LG0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp16Q99LG0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp16Q99LG0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms