Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RtcbQ99LF4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms