Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hps4Q99KG7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hps4Q99KG7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms